受查核公司為本法第二十條第二項資本額達3,000萬以上之公司，其財務報表應先經會計師依「會計師查核簽證財務報表規則」及一般公認審計準則規定查核簽證。

依照所得稅法102條之規定，公司行號得選擇委託會計師查核簽證其所得稅申報案件，會計師會依照「營利事業委託會計師查核簽證申報所得稅辦法」於公司行號申報前進行查核之工作。

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所得稅法賦予公司行號委託會計師查核簽證所得稅申報案件下列好處：
1. 降低查帳風險:國稅局對會計師事務所出具之報告作書面審核，公司被查核機率較低。除可降低補稅風險外，亦可減少投入力來應對國稅局查核。
2. 盈虧可互抵: 企業虧損可保留10年並可於往後獲利當年度予以扣抵。
3. 交際費限額提高：對於交際費較高的公司，可有效減輕稅負。

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另外稅法亦有強制下列公司應委任會計師辦理簽證，請注意：
1. 金融業。
2. 公開發行公司。
3. 享免稅優惠且營業收入在5,000萬元以上。
4. 年營業收入在1億元以上者。

1. 財務報表查核簽證
2. 期中財務報表核閱

依公司法及公司申請登記資本額查核辦法之規定辦理公司設立資本額之查核簽證。
公司法第七條：公司申請設立登記之資本額，應經會計師查核簽證；
公司應於申請設立登記時或設立登記後十五日內，檢送經會計師查核簽證之文件。
公司申請變更登記之資本額，應先經會計師查核簽證。

1. 直線扣抵法簽證。 　　
2. 營業人因申請註銷登記申報退還溢付營業稅額，經會計師查核簽證者，得申請列為先退後審案件專區。